慢性扁桃体炎可以引起远隔部位的器质性病变和功能障碍，这种情况就意味着扁桃体炎已成了身体的一个感染病灶。现在有证据证明病灶性扁桃体炎与低热、风湿病、皮肤病、虹膜炎、关节炎、肌炎、心肌炎、心内膜炎、肾小球肾炎、肾盂肾炎、支气管哮喘、神经炎等有关。至于与强直性脊柱炎有什么关系，还没有看到相关的报导。另外全身作为病灶的不止是慢性扁桃体炎，还有牙齿疾病、鼻窦炎、中耳炎等，都能引起上述的并发症。
